{"id":2646,"date":"2022-08-09T11:17:11","date_gmt":"2022-08-09T09:17:11","guid":{"rendered":"https:\/\/cliniquedugazon.fr\/?p=2646"},"modified":"2022-09-15T09:27:09","modified_gmt":"2022-09-15T07:27:09","slug":"explorateur-de-donnees-du-ntep-le-nouvel-outil","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/cliniquedugazon.fr\/index.php\/2022\/08\/09\/explorateur-de-donnees-du-ntep-le-nouvel-outil\/","title":{"rendered":"Explorateur de donn\u00e9es du NTEP : le nouvel outil !"},"content":{"rendered":"

\u00c7a fait longtemps qu’on l’attendait ! <\/i><\/h1>\n
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Q<\/span>ui n’a pas ressenti de la frustration en essayant de chercher et trier les donn\u00e9es des essais nationaux am\u00e9ricains sur les gazons (NTEP)<\/a>. Une mine d’or pour qui sait \u00eatre patient mais un casse t\u00eate pour utiliser correctement les r\u00e9sultats et les comparer entre eux.<\/p>\n

En effet, alors que les essais des programmes nationaux am\u00e9ricains sur les gramin\u00e9es \u00e0 gazon existent depuis le d\u00e9but des ann\u00e9es 90, les r\u00e9sultats ont toujours \u00e9t\u00e9 pr\u00e9sent\u00e9s de mani\u00e8re archa\u00efque avec des bons vieux fichiers textes que l’on pouvait extraire au format PDF. D\u00e8s lors qu’on voulait comparer plusieurs s\u00e9ries, plusieurs localisations ou faire des moyennes c’\u00e9tait un cauchemar.<\/p>\n

A titre d’exemple, dans un de mes articles sur la s\u00e9lection vari\u00e9tale pour la r\u00e9sistance \u00e0 la Pyriculariose<\/a>, j’avais repris entre autre l’int\u00e9gralit\u00e9 des r\u00e9sultats du NTEP <\/a>pour ce crit\u00e8re et cela m’avait co\u00fbt\u00e9 un paquet d’heures d’extraction et de tri des r\u00e9sultats \u00e0 la main.<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n\n

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Figure 1 : exemple de donn\u00e9es disponibles sur le site officiel du NTEP pour les qualit\u00e9s g\u00e9n\u00e9rales d’une s\u00e9rie sur les raygrass anglais : un fichier texte inutilisable pour traiter, trier ou filtrer les donn\u00e9es sans grosses comp\u00e9tences en programmation ! Source :<\/strong> \u00ab\u00a0NTEP<\/a>\u00ab\u00a0. Licence :<\/strong> National Turfgrass Evaluation Program<\/a>, tous droits r\u00e9serv\u00e9s \u00a9<\/a><\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n

Des fonds d\u00e9bloqu\u00e9s sur les f\u00e9tuques rouges auront permis le d\u00e9veloppement du nouvel outil : le NTEP Trial Explorer<\/h1>\n\n\n\n

En 2017, le professeur Eric Watkins<\/a>, de l’universit\u00e9 du Minnesota et qui avait travaill\u00e9 pour le comit\u00e9 du NTEP <\/a>entre 2014 et 2018 a re\u00e7u des fonds pour travailler sur les f\u00e9tuques rouges. Ce dernier se servit des donn\u00e9es du NTEP <\/a>pour constituer une base de donn\u00e9es sur cette esp\u00e8ce de gramin\u00e9es \u00e0 gazon. Naquit alors une interface d’exploration des donn\u00e9es disponibles ce qui donna naissance \u00e0 l’explorateur de donn\u00e9es du NTEP <\/a>o\u00f9 \u00ab\u00a0NTEP Turfgrass Trial Explorer\u00a0\u00bb disponible via ce lien<\/a> et h\u00e9berg\u00e9 sur le serveur de l’universit\u00e9 du Minnesota<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

Un outil version BETA aux multiples fonctions<\/h1>\n\n\n\n

La premi\u00e8re mouture de l’outil se veut sobre mais elle permet la s\u00e9lection d’un cultivar, des ann\u00e9es o\u00f9 le cultivar a \u00e9t\u00e9 test\u00e9 puis \u00e9ventuellement de filtrer par type de sol, teneur en azote, potassium, gamme de pH, localisation et plusieurs autres param\u00e8tres d’entr\u00e9e du NTEP .<\/a> L’application se charge ensuite de trier et afficher automatiquement les r\u00e9sultats sur l’int\u00e9gralit\u00e9 des ann\u00e9es de l’essai ou encore ann\u00e9e par ann\u00e9e (en g\u00e9n\u00e9ral, chaque s\u00e9rie dure 4 ans).<\/p>\n\n\n

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Figure 2 : interface du nouvel outil le \u00ab\u00a0NTEP Turfgrass Trial Explorer\u00a0\u00bb. Diff\u00e9rents param\u00e8tres peuvent \u00eatre s\u00e9lectionn\u00e9es avant le tri automatique r\u00e9alis\u00e9 par l’application. Source :<\/strong> \u00ab\u00a0NTEP Turfgrass Trial Explorer<\/a>\u00ab\u00a0. Licence :<\/strong> Universit\u00e9 du Minnesota<\/a>, tous droits r\u00e9serv\u00e9s \u00a9<\/a><\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n

La partie la plus int\u00e9ressante consiste \u00e0 pouvoir exporter les donn\u00e9es au format *.CSV (ouvrable sur Excel <\/a>ou Open office<\/a>) pour filtrer et trier les donn\u00e9es de mani\u00e8re personnalis\u00e9e ou encore traiter les donn\u00e9es avec n’importe quel autre logiciel de statistiques. <\/p>\n\n\n\n

La version 1.0<\/a> repr\u00e9sente une premi\u00e8re mouture qui risque d’\u00e9voluer par la suite.<\/p>\n\n\n\n

Bref, un super outil pour les diff\u00e9rents acteurs de la fili\u00e8re qui souhaitent se renseigner sur les qualit\u00e9s de chacun des cultivars test\u00e9s dans cette mine d’or de donn\u00e9es du NTEP <\/a>.<\/strong><\/p>\n\n\n

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Figure 3 : R\u00e9sultats d’une requ\u00eate effectu\u00e9e dans l’application pour une vari\u00e9t\u00e9 d’agrostide stolonif\u00e8re. L’utilisateur a la possibilit\u00e9 d’exporter les r\u00e9sultats au format *.csv. Source :<\/strong> \u00ab\u00a0NTEP Turfgrass Trial Explorer<\/a>\u00ab\u00a0. Licence :<\/strong> Universit\u00e9 du Minnesota<\/a>, tous droits r\u00e9serv\u00e9s \u00a9<\/a><\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n

Pour aller plus loin, un article en anglais du magazine Golf Course Management permet d’en savoir un peu plus<\/a>.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

\u00c7a fait longtemps qu’on l’attendait ! Qui n’a pas ressenti de la frustration en essayant de chercher et trier les donn\u00e9es des essais nationaux am\u00e9ricains sur les gazons (NTEP). Une mine d’or pour qui sait \u00eatre patient mais un casse t\u00eate pour utiliser correctement les r\u00e9sultats et les comparer entre eux. 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